Die Kirche ist orientiert, in Blockbauweise mit einem steilen Blechdach gebaut. Sie besitzt keinen Turm – ein kleiner Turm auf dem Dach der Kirche wird als Glockenturm benutzt. Ende des 19. Jahrhunderts wurde das Gebäude um eine einschiffige Vorhalle mit einem schmaleren, dreiseitig geschlossenen Presbyterium erweitert. Der Innenraum der Kirche ist mit einer flachen Decke bedeckt. Das Ganze – sowohl die Wände als auch die Decke – sind mit einer Schicht von Brettern bedeckt.

In der Kirche wird die Aufmerksamkeit auf den Renaissance-Barock-Altar mit Barockgemälden aus der 2. Hälfte des 17. Jahrhunderts gelenkt, die die Tröstende Gottesmutter, die Verkündigung, die Heilige Kinga und Szenen aus dem Leben der Klarissen des Sącz Ordens darstellen. Es gibt auch Renaissance-Gemälde mit Szenen der Kreuzigung und der Auferstehung aus dem 16. Jh. (um 1580 datiert).

Im Dezember 1980 wurde im neu entstandenen Stadtteil Nowy Sącz mit der Bezeichnung Helena die Pfarrei St. Helena gegründet. Die historische Kirche, die bis dahin als eine Friedhofskapelle diente, wurde zur Pfarrkirche. Wegen der großen Zahl von Gläubigen, die in der Holzkirche nicht untergebracht werden konnten, wurde 1983 mit dem Bau einer zweiten Kirche auf dem Pfarrgelände begonnen. Nach Abschluss der Arbeiten und der Einweihung der neuen Kirche dem Heiligen Kreuz im Jahre 1990 übernahm sie die Funktion der Hauptkirche auf dem Pfarrgelände und die Kirche St. Helena wurde zur Hilfskirche.